Le logiciel RASTOP est un logiciel qui permet l’étude de la fonctionnalité des molécules du vivant par la découverte de leur composition et de leur organisation dans l’espace.
1) Il est primordial dans un premier temps de connaitre les fonctionnalités de la barre d’outil afin d’étudier la molécule désirée.
2) Cette étape faite, on peut donc sélectionner la molécule en question. Aller dans fichier/ouvrir/molécule... Si cette dernière n’est pas contenue dans le fichier de l’ordinateur, il faut de ce fait aller sur le site suivant la télécharger : librairiedemolécules.education.fr
3) La molécule étant sélectionnée différents outils vont nous permettre de mettre en évidence les fonctionnalités de la molécule :
- Si l’on désire étudier sa structure, on peut dans un premier temps la visualiser selon différentes formes (ruban, boule, étoiles..) en les sélectionnant dans la barre d’outil.
- Dans un deuxième temps, on peut sélectionner des atomes/monomères/chaine d’intérêt qui mettent en évidence une particularité de la molécule. On peut également, si cette molécule est constituée de plusieurs sous unités en sélectionner une.
- Si l’on désire comparer l’organisation tridimensionnelle de la molécule seule avec celle de la molécule en interaction avec une autre molécule, on peut ouvrir une autre fenêtre et charger les molécules en question en ouvrant une nouvelle fenêtre.
- On peut également comparer la structure de la molécule saine avec celle de la molécule modifiée (par exemple HBS HBA) et comprendre les effets d’une mutation par exemple sur la fonctionnalité de la molécule.